ImageJ関連

一般事項

• ImageJ Wiki


• ImageJ(本家)
• ImageJ - Wikipedia


• ImageJ Basics - YouTube
• Intro to ImageJ/Fiji - YouTube


• Using ImageJ to Quickly Analyze Lung Slice Airway Area - YouTube
• Automated Cell Counting in ImageJ - YouTube
• Thresholding segmentation and measuring shapes in ImageJ - YouTube


• ImageJプラグインの作成:序論
• バイオイメージング研究のためのImageJによるデジタル画像解析法(2012年6月版)
• ImageJを使った画像解析実習〜数・形態・分布の解析〜
• ImageJを使った画像解析実習〜2値化・領域抽出〜
• ImageJを使った画像解析実習〜大量の画像データに対する処理の自動化〜


• ImageJ - Qiita

ImageJ Fiji

• ImagJ Fiji(本家)
• Fiji (software) - Wikipedia
• List of update sites - ImageJ


• ImageJ Fiji のインストールと Fiji - バイオ系だけどプログラミング始めました


• Introduction and Segmentation in FIJI - YouTube
• Trainable Weka Segmentation using Fiji - YouTube

マクロ

• 10分でできる ImageJ 自動化 - バイオ系だけどプログラミング始めました
• ImageJマニュアル：ImageJマクロ言語 - ImageJ日本語情報
• Wet研究者がコスパ良く手抜きをするためのimageJマクロ｜Kd_Gn｜note
• 03c ImageJ Macro programming: Recording Macros and working with images - YouTube
• FIJI for Quantification: Recording and Running a Macro - YouTube
• 30 min Introduction to Fiji/ImageJ for bioimage/microscopy analysis. - YouTube


• ImageJ のマクロ - 金魚亭日常
• 【ImageJ/Fiji】マクロ作成

plugin

• List of Extensions


• imageJにプラグインを導入する
• saiboukougaku/installingPlugins.md at master · miura/saiboukougaku · GitHub
• 【ImageJ】細胞の核を数える 番外編〜新しいプラグインを導入する
• ImageJ/FIJI plugin: Semi-automatic cell-by-cell object-based colocalization analysis - PART 1 - YouTube
• ImageJ plugin: Semi-automatic cell counting (with colocalization / categorization) - YouTube


• ImageJでのプラグイン開発 - Qiita
• ImageJ plugin で Hello world! #2 - IMACEL Academy -人工知能・画像解析の技術応用に向けて-| エルピクセル株式会社
• ImageJ Plugin を作るための Java #1 - IMACEL Academy -人工知能・画像解析の技術応用に向けて-| エルピクセル株式会社
• ImageJプラグインの作成:序論
• ImageJの便利なインターフェースについて: WAKU-TAKE-A PROGRAM


• Developing ImageJ Plugins
• src/ImageJ/plugin-ij · master · OpenSource / leversc · GitLab
• BioImage-IT / BioImageJ · GitLab
• Basic Issue With Using Template Matching In Fiji Or Imagej

Python(ImageJ Fiji)

• ImageJ Fiji + Python で画像解析プログラムを書こう（前編） - バイオ系だけどプログラミング始めました
• ImageJ Fiji + Python で画像解析プログラムを書こう（中編） - バイオ系だけどプログラミング始めました
• ImageJ Fiji + Python で画像解析プログラムを書こう（後編） - バイオ系だけどプログラミング始めました
• ランダムな砂嵐画像を作る ImageJ + Python のプログラム - バイオ系だけどプログラミング始めました
• ImageJ で米粒（細胞）を数えて解析しよう。 - バイオ系だけどプログラミング始めました
• ImageJ + Python の活用例：自動米粒解析プログラム - バイオ系だけどプログラミング始めました